Septembra 1943 je bil Boštanj prizorišče spopada med partizanskimi enotami Cankarjeve brigade in vaško stražo, ki se je pod poveljstvom Danila Capudra utrdila v gradu.
Po neuspešnih pogajanjih je 12. septembra sledil napad, ki se je nadaljeval tudi naslednji dan. Pri napadu so bili uporabljeni topova in težki minometi, ponoči pa so bila razstreljena glavna vrata gradu. Branilcem je uspelo zapustiti grad in se umakniti proti Turjaku.
Grad je bil med spopadi poškodovan in nato požgan. S tem se je začelo njegovo dokončno propadanje.