Marjan Šorli je bil poročen z Marjo Udir. Rodile so se jima tri hčere: Vida (1942–2011), Maja (1945–2018) in Veselka (1949–2017).
Vida Šorli, poročena Demšar, je bila oblikovalka notranje opreme. Do leta 1966 je delala skupaj z očetom v Agrobiroju kot tehnična risarka. Njen mož Peter Demšar je bil oblikovalec notranje opreme in mizarski mojster, ki je zelo dobro poznal materiale in tehnologijo izvedbe, zato je rad sodeloval z Marjanom Šorlijem in izdeloval pohištvo po njegovih načrtih.
Maja Šorli, poročena Repanšek, je bila ekonomistka, govorila je več jezikov in bila vse življenje aktivna v zunanji trgovini slovenskih podjetij. V mladosti je bila strastna tabornica, kasneje pa je veselje našla v potovanjih in raziskovanju kulturne dediščine.
Veselka Šorli, poročena Puc, je bila akademska slikarka, likovna kritičarka in pisateljica. Predavala je na Visoki šoli za storitve VIST v Ljubljani, kjer je leta 2009 prevzela predstojništvo smeri Fotografija. Ilustrirala je več knjig in napisala dve: Zgodbe z repom in glavo ter Ure pasjih dni.
Vnuki in drugi sorodniki Marjana Šorlija živijo blizu in daleč, domačijo v Šorlijevem mlinu pa vzdržuje njegov nečak Stanko Šorli.
